那覇空港事務所によると、相次ぐ落雷のため、日本航空と全日空、スカイマークの3社系の地上作業員が14日午前9時20分ごろから同10時30分ごろの間、屋内避難した。そのため着陸機が駐機場に入れず、1時間以上待機する便があった。離陸にも遅れが出ており、合わせて数十機の運航に影響が出ている。この影響による欠航便はないという。悪天候のため上空で着陸待機する便もあった。

雷雨を伴う豪雨の影響で、沖縄本島地方では14日午前、中南部を中心に各地で冠水が発生した。県警によると同日午前11時までに人的被害や土砂災害などは確認されていないが、冠水で車両が水没する被害が各地で確認されているという。